Durch direkte und (daraus folgende) indirekte Auswirkungen schwimmender Photovoltaik Anlagen ist mit (theoretischen) Auswirkungen für die Beschaffenheit eines Sees bzw. die kennzeichnenden Beschaffenheitsparameter zu rechnen, wie: 

• Temperaturhaushalt infolge veränderter Wasserzirkulation.
• Sauerstoffhaushalt durch veränderte physikalische und biogene Belüftung.
• Ab- und Umbauvorgänge im Wasserkörper (Gewässergüte), u.a. als Folge des veränderten Temperatur- und Sauerstoffhaushaltes. 
• Besiedlungsbild insbesondere von Makrophyten und Phytoplankton durch veränderte Nährstoffbedingungen und ein anderes Einschichtungsverhalten.  

Um die Auswirkungen schwimmender Photovoltaik Anlagen auf die Gewässergüte im Einzelfall nachvollziehbar darzustellen und ggf. Anpassungen vornehmen zu können, empfiehlt es sich, zunächst eine Machbarkeitsstudie unter Verwendung geeigneter Prognosemodelle durchzuführen. 

Als Beispiel sei hier das kurz zusammengefasste Ergebnis einer entsprechenden Untersuchung eines Baggersees in der Oberrheinebene angeführt. Untersucht wurden die Auswirkungen einer schwimmende Photovoltaik Anlage auf die Gewässergüte des Sees mit einem Prognosemodell und unter Verwendung von Literaturquellen (Lit.). Die Darstellung erfolgte für die Auskiesungsphase und für die Entwicklung nach Einstellung der Auskiesung unter der Voraussetzung von zwei Nutzungsvarianten mit unterschiedlichen Auswirkungen auf die beiden meteorologischen Wirkgrößen Globalstrahlung und Windgeschwindigkeit.

Die Modellierung lässt Variantenprüfungen mit unterschiedlichen Formen der Anlagenausgestaltung zu. Auf diese Weise kann u.a. die maximale Flächengröße der Seeüberdeckung herausgearbeitet werden, ohne dass Erheblichkeitsschwellen zum Beispiel bezüglich Zirkulationsverhalten, Sauerstoffhaushalt oder Blaualgenentwicklungen überschritten werden.